對(duì)于滅菌是否的檢查，還可使用生物指示劑發(fā)酵消泡劑生物進(jìn)行監(jiān)測(cè)，即利用一些已標(biāo)定的耐熱芽孢菌是否殺滅來(lái)直接指示滅菌是否。（一）種子帶雜菌的檢查接種用的種子，常需多次使用生物發(fā)酵消泡劑擴(kuò)大培養(yǎng)，因此，對(duì)每級(jí)種子均加強(qiáng)檢查是非常必要的，可在每次接種后留下少量種子懸浮液進(jìn)行肉湯培養(yǎng)或平板劃線培養(yǎng)，借以檢查是否種子帶菌。為了防止種子帶菌，必須注意保持無(wú)菌室、滅菌鍋和搖瓶的無(wú)菌狀態(tài)。保存的菌種有時(shí)受螨入侵，由螨帶入雜菌，這點(diǎn)也應(yīng)注意。（二）發(fā)酵設(shè)備和管件的染菌這種染菌是指設(shè)備和管件，由于腐蝕或一些其它原因形成微小漏孔后發(fā)生的滲漏現(xiàn)象，如冷卻管的滲漏，管件的滲漏。還應(yīng)注意取消法蘭銜接部分溝槽，以隔膜閥代替球心閥等更為細(xì)小的死角，對(duì)設(shè)備和管件的要求越來(lái)越高。（三）滅菌操作上的污染分批滅菌中，采用生物發(fā)酵消泡劑罐壓1 kg/cm²，料溫120 C維持30 min的一般滅菌操作規(guī)范，是完全可以殺死任何微生物的，但是有時(shí)由于客觀上沒有達(dá)到這種狀態(tài)，例如：1．死角：明顯的設(shè)備死角易發(fā)現(xiàn)，但諸如閥門處的一些不易察覺的死角往往忽視，應(yīng)加強(qiáng)對(duì)這類死角采取措施，如旁路閥門的應(yīng)用等等。2．固形物的堆積：有些固形物特別是麩皮、黃豆餅一類粘著于罐壁、支架上，這些堆積物在滅菌過(guò)程中經(jīng)受干熱作用，它們由于受熱慢，堆積物里雜菌不易被殺滅。物料結(jié)塊，造成料內(nèi)滅菌不透。消除發(fā)酵生物消泡劑培養(yǎng)基中固體物料所造成的不易滅菌的措施，是培養(yǎng)基的完全液化。例如，以淀粉酶、蛋白酶等進(jìn)行水解液化淀粉質(zhì)物料和餅粉類蛋白質(zhì)物料。利用pH指示聯(lián)動(dòng)添加酸、堿，或利用葡萄糖自動(dòng)調(diào)節(jié)發(fā)酵液的pH值，以便取代CaCO₃作緩沖劑。3．泡沫：操作不當(dāng)，大量形成泡沫，泡沫中的空氣和泡沫的薄膜有隔熱作用，熱量不易穿透，潛伏的芽孢不易殺死，因此需使用生物發(fā)酵消泡劑進(jìn)行消泡。（四）采用一些快速、準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)染菌的方法目前利用酚紅肉 湯試驗(yàn)、鏡檢、培養(yǎng)等手段監(jiān)測(cè)微發(fā)酵生物消泡劑發(fā)酵是否染菌，有的因靈敏度不高，有的需時(shí)過(guò)長(zhǎng)，有的憑器官感覺很難快速而準(zhǔn)確地做出判斷，延誤了對(duì)染菌罐及時(shí)做出處理。有時(shí)幾種監(jiān)測(cè)手段得到的結(jié)果不一致，難以做出定奪。因此，快速、準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)染菌更顯得重要。1．溶解氧水平：溶解氧水平異常可用作估計(jì)發(fā)酵是否感染細(xì)。菌、噬菌體的依據(jù)。
　　2．發(fā)酵液pH值：某些雜菌在生長(zhǎng)繁殖過(guò)程中產(chǎn)酸，使發(fā)酵液的pH值異常，因此，可利用發(fā)酵過(guò)程中pH的變化情況，作為染菌的依據(jù)之一。

　　3．排氣組分：當(dāng)發(fā)酵污染雜菌時(shí)，排氣組分常有變化，利用這類異常現(xiàn)象，也可作為早期判定發(fā)酵染菌的依據(jù)。
　　4．發(fā)酵過(guò)程中酶的變化：利用某些雜菌能產(chǎn)生特異的酶，以快速測(cè)定早期是否染菌。本文參考《發(fā)酵微生物學(xué)》一書。