沉淀是溶液中的溶質由液相變成固相析出的過程，主要是為了通過沉淀達到濃縮的目的，或通過沉淀除去非必要的成分；其次將已純化的產物轉為固體便于保存。沉淀法是根據生物發酵消泡劑的發酵產物在等電點時，或在一定濃度的有機溶劑、中性鹽類或有機沉淀劑中溶解度降低而析出沉淀，或生物發酵用消泡劑的發酵產物與一些酸、堿、鹽類等形成不溶性鹽類或復合物而析出沉淀的原理，從而達到分離提取的目的。1、等電點沉淀法有些生物發酵消泡劑發酵產物例如酶、氨基酸和某些抗菌素具有兩性電離的性質，隨著溶液PH值的不同，酸堿極性基團例如氨基酸的氨基與羧基進行著不同程度的解離，從而使整個分子帶有正電荷或負電荷，只有當溶液的PH值達到一定值時整個分子所帶的正負電荷等，靜電荷等于零，形成偶極離子，這時由于分子之間的相互撞擊，通過靜電引力的作用結合成較大的聚合體而沉淀析出，此時的PH值稱為該分子的等電點。因而在等電點時這些生物發酵用消泡劑發酵產物的溶解度最小。用等電點法提取發酵產物就是根據這一性質。由于各種蛋白質分子內部所含堿性氨基酸和酸性氨基酸的數目不同，各種蛋白質的等電點有差別。凡是堿性氨基酸含量多的蛋白質，等電點偏堿性；凡是酸性氨基酸含量多的蛋白質，等電點偏酸性。因為羧基解離度大于氨基解離度，所以，大多數蛋白質的等電點PI＜7.0而接近5.0。同樣氨基酸分子上所含氨基、羧基等極性基團的數目以及各種基團的解離程度不同，也有各自的等電點。酸性氨基酸的等電點偏酸性，堿性氨基酸的等電點偏堿性而中性氨基酸中ɑ-羧基的電離比ɑ-氨基容易，等電點也偏酸性，一般pl為6.0左右。2、不溶性鹽沉淀法某些生物發酵消泡劑的代謝產物在一定的pH值下，能與酸堿或金屬離子、表面活性劑等形成不溶性鹽而沉淀析出，再用適當的方法使復合物溶解達到分離提取的目的，已用于工業生產的有單寧沉淀提取酶、鋅鹽法提取谷氨酸、鈣鹽法提取檸檬酸和鹽酸鹽法提取四環素等等。3、有機溶劑沉淀法近來的研究有所發展，有機溶劑可能破壞蛋白質的某種鍵如氫鍵，使其空間結構發生某種程度的變形，使一些原來包在內部的疏水基因暴露于表面，與有機溶劑的疏水基園結合，形成疏水層，從而使蛋白質沉淀。當蛋白質的空間結構發生變形超過一定程度，就會導致完全的變性。有機溶劑的選擇首先是能和水混溶。只有選用合適的有機溶劑，注意調整樣品的濃度、溫度、生物發酵消泡劑、pH值和離子強度，使這些因子綜合地發揮作用，才能獲得較好的提取效果。4、鹽析法鹽析法又稱中性鹽沉淀法，是酶和蛋白質提純工作中使用較早的方法之一，要使酶蛋白沉淀，就必須破壞其水膜，中和其電荷。由于中性鹽的親水性大于酶蛋白的親水性，當加入大量中性鹽時，它們能奪去酶蛋白表面的電荷，又使酶蛋白表面的電荷被中和，而使沉淀析出。由于各種酶蛋白顆粒的大小及親水程度的不同，使各種酶在同一中性鹽中的溶解度也有差別，因而所需中性鹽的濃度也不一樣。鹽析時，在酶穩定的前提下，使pH值盡可能接近等電點。溫度方面，除考慮對熱特別敏感的酶宜維持低溫外，一般可以不要降低溫度。有時為了純化目的酶，還可以考慮采用分級鹽析技術，分級鹽析分離的可能性由各種酶的鹽析曲線決定。本文參考《發酵微生物學》一書。